引物是什么 引物是DNA还是RNA
数据格式类型
格式扩展名
数据类型
常见数据源
BED (.bed)
注解数据
UCSC
Common Assembly Format (.caf)
装配体常见格式
Sequencher (.seq)
序列文件
Clustal (.aln)
序列比对
FASTA (.fasta, .fas等)
序列和对齐
Solexa/Illumina (.fastq, .fasq等)
带有质量信息的序列
GCG (.seq)
核苷酸和蛋白质序列
GenBank (.gb, .xml)
核苷酸和蛋白质序列数据库格式
Geneious (.xml, .geneious)
偏好设置和数据库
GFF (General Feature Format)
基因组注解文件
MEGA (.meg)
分子进化分析
3D分子结构文件
(.pdb, .mol, .xyz, .cml等)
3D结构数据库和程序
Phylogenetic Trees (Newick Format)
(.tre, .tree等)
进化树文件
PDF (.pdf)
文档和演示文件
[其他]
[从公共数据库导入数据]
[数据类型]
[可以方便地从NCBI和UniProt下载数据]
[输出文件格式]
[输出格式多种多样]
输出数据类型包括:DNA序列、氨基酸序列、色谱图序列、带有质量信息的序列、注释、多重序列比对、装配、进化树、PDF文档等。其中: - DNA和氨基酸序列:可以输出为FASTA、Genbank XML、Genbank平面格式等; - 染色体序列和其他类型序列,可以以AB1格式或其他软件特定格式输出; - 对于图表或文件属性等管理操作,则可以用CSV、TSV、WIG或Geneious的格式来保存或共享。 - 论文和文章等文献资料,可以导出为EndNote 8.0等格式。 管理本地文件时需考虑各类数据类型和各种不同的扩展名文件。通过了解它们的特性,我们可以在分析处理数据时更为便捷高效。